No sé cómo se hace con ese software en particular, pero los fiduciales que siempre uso son solo un pequeño punto de cobre con la máscara de soldadura y la pantalla de seda limpia en sus inmediaciones. Esto debe ser posible con cualquier software competente.
Uso Eagle, y ahí solo hay un círculo relleno en la capa superior de cobre, con un círculo más grande lleno de máscara de soldadura en la misma coordenada. En Eagle, dibujar en la capa de máscara de soldadura (tStop) elimina la máscara de soldadura. Luego los coloco en lugares convenientes, en coordenadas redondeadas, como el último paso en el diseño del tablero. Por lo tanto, me aseguro manualmente que no haya una serigrafía dentro del orificio de la máscara de soldadura.
Acabo de verificar, y mi fiducial estándar es un punto de cobre de 20 mil de diámetro dentro de un orificio de máscara de soldadura de 50 mil de diámetro. He tenido varios fabricantes diferentes que hacen tablas con estos fiduciales en ellas, y nunca he recibido ninguna queja. Necesitas tener al menos dos en esquinas opuestas. Para tablas grandes, generalmente pongo una en cada esquina.