El esquema que muestra tiene las entradas! HI y LO emparejadas. Esto significa que solo necesita una señal para conducir cada fase, pero que el FET superior o inferior en cada pahse siempre será conductor. Esto es común con una unidad sinusoidal, donde cada fase recibe una PWM que varía continuamente para aproximarse a una tensión sinusoidal en los terminales del motor, pero como usted indica que quiere tener una fase flotante, asumo que apunta a una unidad trapezoidal - Lo que no se puede lograr con ese arreglo. Tendrás que controlar las seis entradas de forma independiente.
Para cada posible disposición de los sensores Hall, que pueden disponerse de varias maneras alrededor del estator, y los devanados (los devanados de fase se pueden conectar de cualquier manera al patrón de estrella o triángulo, invirtiendo la dirección física de rotación) habrá una tabla de conmutaciones necesarias - debe estar disponible por parte del fabricante del motor. 
Estosehatomadodelahojadedatosde DRV8307 que muestra una tabla típica. Dado que sus entradas de HI están invertidas, deberá invertir las señales en ellas.
La nota (1) sobre la rectificación síncrona es un nombre poco apropiado (que se utiliza en los suministros de modo de conmutación) pero funciona igual en los inversores: enciende el FET que, de lo contrario, circularía a través del diodo del cuerpo, lo que reduce las pérdidas y mejora la eficiencia.
