Puede encontrar otro simulador como ghdl (código abierto) es más rápido que ISIM para muchos diseños, aunque hay menos ( no) dinero de desarrollo disponible para optimizar su rendimiento.
Si estructura sus bancos de prueba como pruebas independientes, como lo favorece Vunit (un marco de prueba de unidades VHDL) , puede ejecute varias instancias de ghdl (o herramientas de simulación comerciales como Modelsim si puede pagar suficientes licencias) en paralelo, simplemente configurando opción de línea de comando , hasta el número de procesadores en su sistema.
(Esto supone que estás usando vhdl, no mencionaste ningún HDL en tu publicación. No sé el estado de las herramientas de simulación para verilog)