Tuve 2 series de circuitos de la serie LED que funcionan con 12V DC, 1A como se muestra a continuación. Cada conjunto será de 3 series de cuatro LEDs. Mi problema es que cuando me conecto a una fuente de 12VCC, 1A, el brillo de set1 es mayor que set2. Como superar este problema ? 
Conecte cada juego individualmente a la fuente de alimentación.
Habrá una caída de voltaje en el cableado, dependiendo de la corriente y de la longitud del cable. En su circuito, el conjunto 2 recibirá un voltaje más bajo que el conjunto 1 debido al cable adicional entre los conjuntos.
El aumento del calibre del cable (diámetro) también reducirá la caída de voltaje en el cableado.
No especifica la longitud de su cableado ni el calibre de cableado. Pero su diagrama muestra que está conectando en serie las conexiones de la fuente de alimentación. Esto agrega más resistencia para la segunda banda, lo que podría disminuir su brillo. Intente cablear cada tira de LED directamente a la fuente de 12 voltios utilizando la misma longitud y calibre de cable para cada una. También sería útil aumentar el cable del calibre para ambos.
Su diagrama muestra que está conectando los LED directamente a la fuente de alimentación sin ningún tipo de limitación de corriente. Esto generalmente no es una buena idea. Pero para mejorar la situación, necesitaría una fuente de alimentación de mayor voltaje. Si tiene uno, indique en los comentarios lo que tiene y puedo agregarlo a esta respuesta.
Finalmente, considere que los LED del mismo número de parte vienen en diferentes grados de brillo. Es posible que sus tiras sean simplemente dos grados diferentes. Al reducir la corriente en la franja más brillante, se puede hacer que coincida con la otra franja.
El culpable aquí parece ser la fuente de alimentación.
Si cada conjunto necesita 12V 1A y está conectando 2 conjuntos en paralelo, su demanda actual será 2A. Una sola fuente de alimentación de 12V 1A no podrá suministrar suficiente corriente y comenzará a disminuir el voltaje. Como resultado de todo esto, los LED comenzarán a mostrar una impedancia más alta de lo que es deseable, debido a un sesgo insuficiente.
Debido a las tolerancias de fabricación, los LED de cada conjunto tendrán diferentes impedancias en esas malas condiciones de desviación y, como resultado, una de las ramas podría atraer más corriente (y su luz sería más brillante) que la otra.
Pruebe la siguiente prueba: conecte cada conjunto individualmente a la fuente de alimentación, uno a la vez. Si cada conjunto muestra un brillo completo probado de esta manera, el culpable es la fuente de alimentación.