Normalmente, debe elegir estos límites antes de comenzar el diseño y configurar las reglas de diseño en su herramienta de diseño para que le avise si los viola. Luego genere su gerber a partir de archivos de diseño de diseño que sabe que no infringen las reglas.
La mayoría de las fabs (no sé nada acerca de PCBWay) tendrán herramientas que puedan examinar los gerberos que envías para verificar estas cosas y verificar la capacidad de fabricación. Luego le enviarán un informe indicando las violaciones y las soluciones propuestas para su aprobación (o pidiéndole que confirme que pagará por los tableros, incluso si son defectuosos debido a una violación de la regla). Es posible que una fábrica de bajo costo no proporcione este servicio si utiliza el servicio de menor costo. Desafortunadamente, estas herramientas son bastante costosas y, por lo general, no son económicas si las compra un diseñador de tableros individual. Solo he trabajado en una empresa que ha licenciado este tipo de herramienta en casa.