El circuito que conectaste es un horrible convertidor de voltaje. No tiene retroalimentación en el circuito para ajustar dinámicamente el ciclo de trabajo para regular el voltaje de salida. El circuito adicional en esa página web que muestra el uso de un transistor de potencia con un diodo Zener para compensar las fallas del circuito 555 también es un enfoque horrible.
Hay una gran cantidad de chips y módulos de controlador de fuente de alimentación de conmutación disponibles que harán un trabajo mucho más superior para convertir el voltaje de 12 a 5 voltios. Consigue uno y usa eso en su lugar.