La modificación es una parte adecuada del diseño del producto. Entonces, no, no "dibuje a mano eso en el PDF".
Agrégalo a los esquemas. De todos modos, debería tener un control de versiones adecuado para sus esquemas (pruebe git. Está pensado para el código fuente, pero funciona con cualquier tipo de archivo; simplemente no se muestran diferencias útiles entre las revisiones, pero eso no es un problema aquí). Anotarlo claramente en sus esquemas. Si su suite EDA lo permite, cambie el color, el trazo, cualquiera que sea la modificación para aclarar que es una modificación.
Si su modificación es solo un puente de conexión: no es raro que los programas de diseño esquemático tengan algún tipo de componente especial de "conexión externa".
Como es probable que aún desee poder generar una placa válida a partir de ese esquema, asegúrese de que el componente de "conexión externa" que tiene tenga una pequeña almohadilla única que pueda colocar en un cable en el diseño de su placa. De esa manera, también obtienes una garantía de que también tienes algo para soldar al final.
Una vez más, no sé qué software utilizas, pero todavía tendrá sentido "formalizar" incluso el truco más burdo en algún tipo de huella / componente: tu puente de cable podría consistir simplemente en dos componentes con una almohadilla cada uno. , que comparten el mismo nombre de red. De esa manera, realmente podría "colocar" la solución en el diseño de su placa y, por lo tanto, documentarla.
Además, su tarjeta puede fallar en las comprobaciones de las reglas de diseño. Lo que obviamente sería correcto.