¿Qué es el formato de los datos de salida de una cámara web?

Si quieres hacerlo todo en hardware ... Buena suerte. Debe implementar el estándar USB, o al menos una parte de él, y luego encontrar una manera de traducir lo que su ADC envíe en paquetes usb.

Si puede integrar un procesador en su FPGA, sería mucho más simple. Con altera puede integrar el procesador nios II, por lo que creo que xilinx tiene su propio procesador. Cuando tenga el procesador, puede agregar una interfaz usb asignada en memoria, que generalmente es proporcionada por el proveedor de FPGA, y luego hacer las cosas en el software. Eso es más lento, pero de nuevo, eso es mucho más fácil. Por supuesto, necesitará un puerto personalizado en su procesador que se comunique con el ADC.

Si tiene suficiente memoria, incluso puede ejecutar un poco de Linux en el FPGA ...

Para responder directamente a sus preguntas:

1) Búsquelo, hay varios estándares y tal vez sea más fácil usar uno en lugar de otro. 2) Creo que envían datos comprimidos, aunque no estoy seguro. 3) Eso depende de lo que su máquina linux espera

Solo una suposición final: si compró ese ADC significa que sabe cómo conectarlo a su cámara IR, supongo que los circuitos integrados que aceptan ese tipo de entrada analógica y los traducen a un puerto USB. Su proyecto puede ser tan fácil como soldar una docena de cables.