Su pregunta no es muy clara, pero voy a intentar una respuesta de todos modos.
Cuando una MCU sale del reinicio del hardware, los periféricos generalmente están en estado inactivo, pero la memoria interna y los registros (excepto el PC y el registro de estado) generalmente no están inicializados.
Sin embargo, y especialmente cuando se trabaja con un lenguaje de alto nivel (compilado), la mayoría del código se genera para trabajar en un entorno en el que ciertos registros tienen valores bien definidos y la memoria tiene ciertas estructuras de datos en su lugar, como como una pila, un montón y datos globales / estáticos inicializados.
El "segmento de arranque" es la tarea de pasar del primer estado de cosas al segundo. Está escrito para funcionar en el "entorno" mínimo creado por el reinicio del hardware y crea el entorno más estructurado que espera el código de la aplicación.
Si la MCU también tiene acceso a la memoria externa, a veces hay un controlador de memoria que debe inicializarse, especialmente si esa memoria es SDRAM, y luego las estructuras de datos en la memoria que residen allí también se pueden inicializar. Si el código ejecutable o los datos inicializados residen en esa memoria externa, esto debe hacerse antes de que se carguen el código de la aplicación y los segmentos de datos.
El segmento de arranque normalmente se incluye en la "biblioteca de tiempo de ejecución" de cualquier sistema de desarrollo de software con el que esté trabajando, y rara vez necesita lidiar con él. Sin embargo, es posible que deba configurarse con parámetros específicos de la aplicación, como la configuración de registro del controlador de memoria y la cantidad de memoria que se asignará a la pila, el montón, etc.