Puedes simular esto con bastante eficacia en Altium Designer.
Altium tiene lo que ellos denominan "Esquemas reciclables": diseños esquemáticos que puede pegar en esquemas más grandes y tratar como componentes.
Duplicar el final de PCB es un poco más de trabajo, pero definitivamente es factible (lo he hecho). Básicamente, enruta el DC-DC en una placa y luego simplemente copie y pegue el diseño en cualquier placa nueva que tenga. Esto moverá las huellas de componentes, y los rastros, pero no las redes. Luego, asumiendo que tiene la entidad esquemática correspondiente, la próxima vez que sincronice el esquema y la PCB, Altium hará coincidir las huellas de libre flotación con sus entidades esquemáticas, y agregará las etiquetas de red al cobre existente.
Como alternativa, suponiendo que está de acuerdo con no poder editar el diseño de DC-DC in situ ( en la PCB ), solo puede pegar el diseño en una biblioteca de huellas, y definir dónde quiere que las entradas y salidas sean.
En este caso, editaría el archivo de la biblioteca y luego propagaría los cambios con la "Actualización de las bibliotecas de PCB". También puede modificar las primitivas de un componente una vez que se haya colocado, pero los cambios no se propagarán a otros lugares donde tenga el componente.
En tercer lugar, Altium puede incrustar una placa en otra: lo uso para hacer paneles, pero creo que probablemente también podría usarlo para incrustar una sección funcional en otra. Sin embargo, no se vincularía con el esquema.
Vale la pena señalar que hago los dos primeros de forma regular en mi trabajo (generalmente con circuitos de interfaz USB FTDI): definitivamente es un enfoque viable.