Tu error probablemente solo sacó los zeners. No dices cuál es el voltaje Zener, pero supongo que está muy por debajo de 12 V.
Las resistencias de 10 kΩ deberían haber protegido los pines del procesador de daños físicos. No dices a qué voltaje está funcionando el procesador. Incluso si fuera 3.3 V, eso deja 8.6 V a través de las resistencias, lo que causaría que menos de un miliamperio fluya a través de los diodos de protección. Es posible que el chip no funcione correctamente, pero probablemente no se haya dañado.
Hay una excepción a esto, que es si el chip se encendió durante el tiempo en que se aplicaron los 12 V. Eso podría hacer que se convierta en un gran SCR que se enganche a través de los pines de alimentación. Dependiendo de cuán robusta sea la fuente de alimentación, esto podría dañar el chip.
1.8 V interpretado como una lógica alta no es en sí mismo un problema sin una especificación. Por ejemplo, con una potencia de 3,3 V y los umbrales alto / bajo garantizados son del 40% y el 60% del suministro, cualquier valor por encima de 1,3 V podría interpretarse como alto. Sin las especificaciones adecuadas, no puedes decir que hay algo roto aquí.
Especificaciones de voltaje del pin
Dice que la especificación de "alto voltaje" es el 60% del voltaje de alimentación, que en este caso fue de 5 V. Primero, solo que "alto voltaje" no es el nombre de ninguna especificación de pin. En realidad leer la hoja de datos. Probablemente está citando el alto voltaje mínimo garantizado, pero esa no es la especificación relevante aquí. Ese es el voltaje por encima del cual el chip siempre promete informar un nivel lógico alto.
Lo que quiere saber está por debajo del voltaje que promete informar siempre de un nivel lógico bajo. Cualquier cosa por encima de ese nivel podría interpretarse como alto, por lo que en realidad obtener un nivel alto no prueba que algo esté mal. Por ejemplo, si el nivel bajo lógico máximo garantizado es el 30% de la tensión de alimentación, solo tendrá un problema si obtiene un nivel lógico alto con menos de 1,5 V de entrada.