¿Cómo configurar dos temporizadores que se ejecutan al mismo tiempo en atmega328p?

Quiero configurar dos temporizadores que ejecuten dos ISR -s con diferentes resoluciones. Un temporizador para contar milisegundos por hora de reloj, otro para contar microsegundos cuando se solicite.
He configurado Timer1 y Timer2 en modo CTC, pero el temporizador con microsegundos (Timer2) obtiene mayor prioridad y el temporizador con milisegundos se ignora (Timer1). Mientras que funcionan bien por separado.

La configuración:

void timer1CtcInit(void)
{

  TCCR1B = 0;
  TCCR1A = 0;


  //set CTC mode
  TCCR1B |= (1 << WGM12);
  // enable compare match interrupt
  TIMSK1 |= (1 << OCIE1A);


  // set OCR0A value for 100 msec
  OCR1A = 0x0619;
  //set 1024 prescaler
  TCCR1B |= (( 1 << CS10) | (1 << CS12));
}
void timer2CtcInit(void)
{

  //Timer 2 interrupt service routine CTC settings, 1 uS:
  TCCR2A = 0;
  TCCR2B = 0;
  //set CTC mode
  TCCR2A |= (1 << WGM21);
  //prescaler 1 for timer2
  TCCR2B |= (1 << CS20);

  // value for 1 usec
  OCR2A = 0x0f;

  //set compare match for register OCRA
  TIMSK2 |= (1 << OCIE2A);
}

ISRs:

ISR(TIMER2_COMPA_vect){
  if (timerFlag){
    tmr2Count++;
  }
}

ISR(TIMER1_COMPA_vect){
  tmr1Count++;
}