Lo que has construido parece ser el llamado "seguidor de origen". Para que el transistor NMOS conduzca, necesita un cierto voltaje de la fuente de la compuerta para conducir la corriente: \ $ v_ {GS} > V_ {th} \ $.
Entonces, digamos que el transistor NMOS está "encendido", entonces el voltaje sobre la resistencia comenzará a aumentar. Esto hace que \ $ v_ {GS} \ $ disminuya, y el transistor NMOS, eventualmente, se apagará si \ $ v_ {GS} \ $ se vuelve demasiado pequeño.
Para que el transistor NMOS siga conduciendo, necesita una cierta caída de \ $ v_ {GS} \ $ para proporcionar al resistor la corriente que desea.
El voltaje de salida máximo que podría alcanzar debido a lo anterior es \ $ V_ {gate} - V_ {th} \ $, y esto solo ocurre para resistencias de salida muy, muy grandes. En sus comentarios, indicó que tiene un \ $ V_ {th} = 2V \ $, y la señal de su reloj cuando está en \ $ V_ {gate} = 3V \ $. Por lo tanto, el voltaje de salida máximo estará alrededor de \ $ 1V \ $.
Si disminuye la resistencia, el transistor NMOS necesita un \ $ v_ {GS} \ $ más alto para conducir la corriente necesaria (en \ $ V_ {GS} = V_ {th} \ $ no conduce casi ninguna corriente ). Es probable que este voltaje "indirecto" adicional en su caso sea alrededor de \ $ 0.8V \ $.