Según mi entender, debería haber una señal PWM generada en la salida.
Sí, el ancho del pulso es la diferencia en la fase.
Los resistores R3 y R4 están ahí para reducir la salida de 12 V del amplificador OP a 5 V.
Correcto.
El resistor R2 está limitando la corriente a través de los diodos D1 y D2.
Correcto.
Sin embargo, no entiendo cómo la caída de voltaje en R1 y R5 se desplaza en fase en la misma fase que la corriente y el voltaje de la fuente V1. ¿Alguien puede explicar eso?
No lo es. El esquema no es correcto. Uno de los transformadores debe controlar la tensión de alimentación, por lo que debe estar directamente a través de la fuente. El otro transformador debe estar monitoreando la corriente de suministro o carga, por lo que debe estar en serie con la carga, ¡y no hay carga en el esquema!
Una vez que se solucionen los problemas del transformador, el resto debería funcionar.
Seguridad: elimina el enlace primario-secundario en la parte inferior de XFMR2.
simular este circuito : esquema creado usando CircuitLab
Figura 1. Esquema modificado que muestra el punto de conexión de carga.
Tenga en cuenta que la corriente de carga pasa a través de el CT, generalmente una o unas pocas vueltas. He mostrado la ruta actual en líneas más gruesas.