El PDF al que has vinculado muestra claramente las almohadillas SMD en el mismo lado de la pizarra:
En Eagle, en el paquete para esa parte, coloca una almohadilla SMD donde cada pin toca la placa. Por lo general, desea que la almohadilla sea un poco más grande que el área de contacto, especialmente en la dirección que se aleja del paquete. A menudo, a 20 milésimas, pasé el final del pin. Esto permite un pequeño error de alineación inicial, deja un lugar para colocar una sonda de alcance y facilita la inspección visual de la junta de soldadura. En este interior, por lo general solo dejo 5-10 mils.
En su caso, hay dos filas con la fila exterior cubriendo la fila interior. Hay pocas razones para extender las almohadillas para la fila interior. Sin embargo, debe tratar las dos filas simétricamente para que la tensión superficial de la soldadura fundida en una fila no saque la otra de sus almohadillas. También debe asegurarse de que haya suficiente espacio entre las almohadillas de la fila interior y exterior.