Creo que estás usando el convertidor IV clásico:
simular este circuito : esquema creado usando CircuitLab
Donde:
$$ V_u = -I_ {in} R_1 $$
Es por eso que tu forma de onda está invertida. Hay un par de maneras de evitarlo.
Puedes agregar un amplificador de ganancia de unidad de inversión después de tu etapa actual, algo como esto:
simular este circuito
Ahora:
$$
V_u = R_1 I_ {in}
$$
Si desea utilizar un solo amplificador operacional, existe otra posibilidad. Tenga en cuenta que este segundo circuito no podría funcionar con su configuración.
simular este circuito
Ahora:
$$ V_u = R_1 I_ {in} $$
El (gran) problema con el último circuito es que su corriente verá un voltaje variable, por lo que su sensor debe ser capaz de proporcionarlo. Por ejemplo, si tiene \ $ I_ {in} = 1mA \ $ y elige \ $ R_1 = 1k \ Omega \ $, el voltaje en la entrada positiva del opamp será 1V. Esto podría o no estar bien para su sensor dependiendo de cómo esté hecho. Los dos primeros esquemas proporcionados en su lugar mantienen el voltaje visto por el sensor (muy) cerca de la referencia vinculada a la entrada no inversora del amplificador operacional, siendo más agradable que el circuito de salida del sensor.