Los reguladores Boost son notorios por necesitar una carga mínima para mantenerlos en regulación. Piénsalo un poco. En el ciclo de trabajo más bajo posible, el inductor se carga por un tiempo muy corto y esto se acumula en energía. Entonces esa energía se libera a través de D2 en el circuito de salida. Puede hacer esto tal vez 50,000 veces por segundo y eso significa que está transfiriendo potencia real a la salida, pero hay una carga demasiado ligera y la salida sigue aumentando. Cuanto mayor sea el voltaje de entrada, mayor será la cantidad de energía que se transfiere por ciclo, de modo que, cuando aumenta la fuente de entrada, la salida aumenta más.
El 1 kohm (R5) que tienes puede que no sea suficiente. Intente poner 100 ohmios en la salida y vea qué sucede.