Todos los sonidos son normales, suponiendo que el cargador esté mal regulado y lo hayas medido sin carga.
1) ¡Ver los voltajes en la etiqueta de la batería! 40V / 3 está dentro de ese rango.
2) El cargador puede proporcionar hasta 45V (15V x3 - ver esa etiqueta nuevamente) bajo carga. Bien puede ser de 48V cuando se descarga, verifíquelo nuevamente mientras se está cargando.
3) Solo se necesitan 2 pines, así que suena normal.
Entonces, prueba las baterías.
Tome una fuente de alimentación de laboratorio, configúrela a 14.4 V y el límite de corriente a 3.6 A (o menos) de acuerdo con la etiqueta de la batería. (O use un cargador de batería de 12V si tiene uno). Cargue cada batería individualmente desde eso hasta que la corriente caiga a 0.5 o 0.25A o alguna cifra similar.
Luego conecte una lámpara de 12V (o alguna otra carga) a través de cada batería y vea cuánto dura: si la carga tarda 2A, duplique el tiempo para obtener la capacidad en amperios por hora. Reemplace cualquier batería que haya muerto por debajo de 12Ah.
Si todos son un poco bajos, reemplace el lote, cualquier otra cosa es economía falsa.