Si el convertidor boost no es aislante, es decir, se basa en que 0V es común a su entrada y salida, por lo que usar un MOSFET de esta manera probablemente no sea una buena idea. Cualquier corriente a través del MOSFET (cuando está encendido) hará que el ruido de 0V en el lado de drenaje sea ruidoso en comparación con el 0V en el lado de la fuente. Esto podría significar que alguna funcionalidad analógica está alterada o al menos se vuelve ruidosa.
Como no ha explicado en detalle qué circuito objetivo está conectado a la salida potenciada y cómo podría interactuar con los 0 voltios potencialmente diferentes en el sistema (debido a esta forma de conmutación), le doy esta respuesta como una precaución.
Es mejor utilizar un MOSFET de canal P que cambie el 3V3, por lo que se mantiene la integridad de 0V.