¿Puedo hacer que la salida de voltaje del fotodiodo sea bipolar?

Puedes hacerlo de forma trivial al reemplazar el riel 0v con tu riel negativo; De este modo, la salida oscilará entre los carriles negativos y positivos. La proximidad de esos rieles depende de la entrada de luz, las características de su fotodiodo y la resistencia; no será una onda cuadrada ordenada, pero requerirá cuadrarse con un comparador.

Dado que sus datos utilizan la codificación NRZ, lo que garantiza que verá una cierta tasa mínima de bordes, también puede usar el acoplamiento de CA para lograr esto sin un riel negativo:

^{simular este circuito : esquema creado usando CircuitLab}

Como dice Nick, simplemente puede acoplar la señal en AC y será bipolar, sin un suministro adicional (pero necesitará un suministro negativo para poder usar la señal).

Esto puede funcionar con señales muy, muy lentas e iluminación brillante (por ejemplo, un láser), pero si tiene señales rápidas y / o niveles de luz bajos, entonces debería usar un amplificador de transimpedancia para reducir el efecto del polo causado por La capacitancia PD y la resistencia de carga.