Es probable que un AtMega esté programado en C o C ++, no en C #.
En la mayoría de los casos, el proveedor de un producto habilitará la "protección de lectura" en dicho chip, exactamente para evitar lo que está intentando hacer. Si olvidó hacerlo, puede leer el chip con un pequeño dispositivo de hardware llamado programador.
Si pudiera leer el chip (descargar el firmware), obtendría lo que está almacenado en la memoria (programa flash y datos de eeprom). Eso es equivalente al código de máquina, o llámelo código de ensamblador, sin ninguna sugerencia a la estructura o significado de él.
Un programador inteligente podría rediseñar algo que se asemeja al código fuente original del código de la máquina, pero el esfuerzo será comparable o incluso mayor que el esfuerzo original de escribir el código.