El circuito de luz intermitente AVR de LED impulsado por MOSFET exhibe un comportamiento desagradable

Parece que hay una confusión entre el operador AND bit a bit & y el operador AND lógico &&

Por ejemplo, esta línea en su código

if ( (PINB && (1<<INPUT)) == 0 ) 

no se convierte en verdadero solo cuando bit1 del puerto B se convierte en alto, pero cuando cualquiera de los bits es alto. Eso sucede porque (1<<INPUT) es > 0, por lo que siempre es verdadero y eso deja el cheque en PINB, será cierto con 0x01 o 0x02 o 0x03 ... 0xff

La forma correcta de verificar el estado de PB1 es

if ( (PINB & (1<<INPUT)) == 0 ) 

Otro lugar donde usas el operador equivocado es

MCUCR = MCUCR && ~( (1<<SM1)|(1<<SM1) ) |  (1<<SM1)|(0<<SM1);

Eso da como resultado 0 o 1, lo que deberías usar es

MCUCR = MCUCR & ~( (1<<SM1)|(1<<SM1) ) |  (1<<SM1)|(0<<SM1);

Llegando a su circuito real, ¿cuál es la necesidad de 74LS14?
Todo lo que necesita es habilitar el pull-up interno para PB1 y conectar el colector opto-transistor al pin del puerto para bajarlo cuando esté activo.

Solo puedes conectarlo como

Y en cuanto al código, algo como

// change the following clock frequency depending on the clock you use
#define F_CPU 9600000UL // 9.6 MHz'
#include <avr/io.h>
#include <util/delay.h>
#include <avr/interrupt.h>
//#include <avr/cpufunc.h>
#include <avr/sleep.h>

#define OUTPUTA 4
#define OUTPUTB 3
#define INPUT   1

volatile uint8_t  useless = 0;
volatile uint8_t  flashing_enable = 0;

ISR(INT0_vect)
{
    if((PINB & (1 << INPUT)) == 0)
    {
        flashing_enable = 1; // set flashing flag
        PORTB |= (1 << OUTPUTA) | (1 << OUTPUTB); // turn on both leds
    }
    else
    {
        flashing_enable = 0; // clear flashing flag
    }
}


int main(void)
{
    DDRB = 0x00 | (1 << OUTPUTA) | (1 << OUTPUTB);
    PORTB = (1 << INPUT); // enable pullup
    // External Interrupt(s) initialization
    // INT0: On
    // INT0 Mode: Any change
    // Interrupt on any change on pins PCINT0-5: Off
    GIMSK = (1 << INT0) | (0 << PCIE);
    MCUCR = (0 << ISC01) | (1 << ISC00);
    GIFR = (1 << INTF0) | (0 << PCIF);
    GIFR = (0 << INTF0) | (1 << PCIF);
    sei();    // enable interrupts

    while(1)
    {
        if(flashing_enable)
        {
            _delay_ms(170);
            PORTB ^= (1 << OUTPUTA);
        }
        else
        {
            PORTB &= ~((1 << OUTPUTA) | (1 << OUTPUTB));
        }
    }
}

He utilizado leds individuales solo para mostrar el esquema de conexión genérico. También he omitido los condensadores, agrégalos a tu hardware real.

La entrada al 74LS14 (pin 1) está vinculada a +5 voltios, por lo que cualquier entrada a través del optoacoplador no tendrá ningún efecto.

Movería R2 para conectar entre + 5V y el pin 1 de 74LS14, con el pin 1 también conectado al colector óptico y el emisor de opto conectado a tierra. Eso permitirá que el opto controle la entrada al 74LS14.

Además de los problemas mencionados en la respuesta anterior, esta línea:

MCUCR &= ~ ( (1<<ISC01)|(1<<ISC00) );   // low level interrupt on INT0

También es bastante incorrecto: no estoy seguro de por qué decidí invertir el valor cargado en MCUCR

Después de agregar un límite a la línea de restablecimiento (Gracias @ Andy aka ), corrigiendo los errores de codificación y cambiando a una interrupción de bajo nivel de interrupción de bajo nivel (ambas señaladas por alexan_e ), la luz intermitente parece estar bien. Mantuve la función de dormir.