Si está utilizando un suministro de 5V, también debe usar el relé de 5V, no uno de 12V.
Mejor no aumente la capacidad, pero use un condensador separado para cada relé. Aún puedes usar un solo interruptor principal, asegúrate de que sea lo suficientemente fuerte como para resistir las chispas en la descarga de los condensadores si tienes muchos de ellos.
Y necesitarás un suministro realmente potente si usarás muchos condensadores. Y los tiempos de recarga del condensador afectarán la frecuencia de los cambios que puede lograr.
Puede agregar resistencias a los condensadores y calcular el tiempo de recarga según el principio del circuito RC.