Un esquema ayudaría.
TLDNR; Un interruptor analógico podría funcionar.
Primero, veamos lo que estás haciendo aquí. Supongo que también está conectando la tierra de su suministro externo de 3.3 V al emisor también (y por lo tanto también al pin de "0 voltios" en el conector de su PSU). Esto funcionará porque los dos suministros están aislados. En términos generales, realmente no sabes QUÉ hay en esos dos pines del conector de la PSU. Es un encendido / apagado remoto, y un NPN no es un relé.
Supongo que está haciendo algo como en el siguiente circuito, que solo funciona porque los 3.3V externos en la base encenderán el transistor y permitirán que los portadores de carga fluyan desde el colector al emisor, completando así el circuito entre su conector externo con ~ 4V y 0V nodos. Con el nodo 0V en GND, no es un problema ya que la GND está flotando con respecto a la GND de su PSU más grande que está intentando encender.
simular este circuito : esquema creado usando CircuitLab
Sin embargo, no funcionará cuando intentes usar los mismos 3.3V de la misma PSU porque probablemente estés causando una conexión entre el nodo de 0V y la GND de la PSU real, por lo tanto el nodo de 0V ya no está flotando, pero conectado a tierra. Es posible que solo esté leyendo ese nodo terminal a 0 V simplemente porque es una entrada de alta impedancia a un circuito de control, y esa entrada debe elevarse a aprox. 4 V desde el otro terminal para encender su PSU. Tan pronto como intente utilizar el mismo 3.3V de la misma fuente de alimentación, se conectará a tierra y nunca podrá elevarse a 4V según sea necesario para encenderlo.
Y todo lo que he dicho anteriormente es una especulación basada en lo que has descrito.
Si tiene un esquema de esa fuente de alimentación, sabrá exactamente qué son esos dos pines, y quizás pueda encontrar una buena manera de encenderlos. De otra manera. es justo lo que en la industria llamamos un cierre de contacto. Usamos un relé o un interruptor para conectar esos dos terminales para encender la PSU.
Como alternativa, puede utilizar la alimentación de 3.3VSB (stand-by) de su PSU para alimentar un interruptor analógico como el conocido CD4066 (74LVQ4066 en 3.3V). El interruptor podría completar el circuito mientras se mantiene aislado de la alimentación de 3.3VSB. Los interruptores analógicos tienen dos MOSFET de canal N y P consecutivos, y la fuente y el drenaje están "aislados" de la puerta y el sustrato, y solo las puertas y los sustratos están referenciados a la fuente de alimentación del chip.
Finalmente, sería mejor saber a dónde van exactamente esos dos terminales dentro de su PSU y cómo están conectados. Aquí es donde un esquema de su fuente de alimentación realmente ayuda. Sin eso, estás volando a ciegas aquí.