¿Puedo salirme con la placa mal diseñada?

Podrías "escapar" con un diseño como este. Un buen diseño de reloj mantiene los rastros lo más cortos posible, y los condensadores y rastros simétricos para mantener los parásitos iguales. Un vertido de cobre también puede ser una buena idea en la capa superior alrededor de los componentes para aumentar la capacitancia a tierra y derivar las señales de alta frecuencia a tierra.

El mayor problema con los cristales son las emisiones radiadas, y dependiendo del país en el que se encuentre, esto podría ser un problema. Es mejor usar buenas prácticas de diseño de relojes para evitar problemas.

Una cosa que podrías hacer es montar el cristal en el otro lado del tablero para disminuir el espacio.

Los límites de carga deben estar entre la MCU y el resonador, de lo contrario, actúan como una antena y podrían captar un ruido adicional que, dependiendo de las condiciones operativas, podría interferir con sus tiempos.

Yo sugeriría dejar el resonador "horizontalmente" (el espacio parece ajustarse) y mover las tapas de carga al lado de la MCU, entre el resonador y la propia MCU.

En teoría, algunos resonadores de PTH más antiguos podrían ser más estables térmicamente que SMD debido a una matriz más grande, aunque sufren algunas desviaciones de frecuencia de las nominales debido a las tolerancias de fabricación.

Depende de lo que quieras decir con salirse con la suya. Hay algunas consideraciones:

1) Sus trazados Xin y Xout son de diferentes longitudes. Parece que la diferencia es lo suficientemente pequeña como para no ser un problema, pero sin saber más sobre su aplicación, no lo sé.

2) Si es un HC49-U, realmente sobresalirá sobre tu chip y hará que sea difícil de probar. Si HC49-S, no se interpondrá en el camino tanto.

3) Si decide cambiar a SMD, tenga en cuenta que tienen una R y una capacidad de pulido muy diferentes a las de HC49 (serán peores que las de HC49-S, que a su vez son peores que las de HC49-S).