Avr múltiples canales ADC y PWM

He estado tratando de hacer un programa que lea continuamente valores analógicos de 3 pines diferentes y luego haga una señal PWM correspondiente a cada uno de esos 3 pines. Básicamente, 3 canales PWM de salida con diferentes ciclos de trabajo correspondientes a 3 valores analógicos diferentes. El problema es que todos los canales PWM comparten el ciclo de trabajo de lo que noté, pero si ignoro el ADC y simplemente configuro el ciclo de trabajo en el código, funcionan bien. Aquí está el código:

#define F_CPU 16000000UL

#include <avr/io.h>
#include <avr/interrupt.h>

void selectADCchannel(uint8_t channel);
void initPWM();
void setupADC();

int main(void){

    sei();
    initPWM();
    //start with 0'th channel; no channel selected needed
    setupADC();

    while(1){

    }
}

ISR(ADC_vect){
    //get current channel
    uint8_t currentChannel = ADMUX & 0x0F;
    //set output compare registers for current channel
    switch(currentChannel){
        case 0x00: OCR0A = ADCH;
            break;
        case 0x01: OCR0B = ADCH;
            break;
        case 0x02: OCR2B = ADCH;
            break;
    }
    //loop through channels from 0 to 2 
    if(currentChannel == 2)
        selectADCchannel(0x00);
    else
        selectADCchannel(currentChannel+1);
    //restart conversion
    ADCSRA |= 1<<ADSC;
    }

void selectADCchannel(uint8_t channel){
    //0xE0 is 11100000
    //0x1F is 00011111
    ADMUX = (ADMUX & 0xE0) | (channel & 0x1F);
}

void setupADC(){
    //enable prescaler (128 for 16MHz => 125kHz)
    //would probably work with 250kHZ for 8 bits
    //set ADPS bits in ADCSRA to 111
    ADCSRA |= 1<<ADPS2 | 1<<ADPS1 | 1<<ADPS0;
    //enable result shift to ADCH to only read ADCH (8 bits)
    ADMUX |= 1<<ADLAR;
    //enable interrupt
    ADCSRA |= 1<<ADIE;
    //set voltage reference
    //reference is AVcc
    ADMUX |= 1<<REFS0;
    //turn on ADC
    ADCSRA |= 1<<ADEN;
    //start conversion
    ADCSRA |= 1<<ADSC;  
}

void initPWM(){
    //TIMER0 (8 bit timer)
    //set pins 5D(OC0B) and 6D(OC0A) as output
    DDRD |= 1<<DDD5 | 1<<DDD6;
    //set fast-pwm mode
    TCCR0A |= 1<<WGM00;
    //set non-inverting mode for both pins
    TCCR0A |= 1<<COM0A1 | 1<<COM0B1;
    //set prescaler to 256
    TCCR0B |= 1<<CS02;

    //TIMER2 (8 bit timer)
    //set pins 3D(OC2B) as output
    DDRD |= 1<<DDD3;
    //set fast-pwm mode
    TCCR2A |= 1<<WGM20;
    //set non-inverting mode for both pins
    TCCR2A |= 1<<COM2B1;
    //set prescaler to 256
    TCCR2B |= 1<<CS22 | 1<<CS21;
}

Entonces, qué debe hacer el programa, después de la inicialización, lea el valor de uno de los pines ADC y luego configure el registro de comparación PWM del pin correspondiente al valor ADCH. Gracias.