Voy a usar MISO/MOSI/SCK pines de AVR de 8 bits con ISP y deberían conectarse al registro de desplazamiento. No van a funcionar simultáneamente, pero la pregunta es cómo aislar el registro del ISP.
Actualización:
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El MCU de Atmel en general funcionará bien con este tipo de conexión. La razón es que la conexión SPI del conector de seis pines se utiliza para la programación, mientras que el AVR se mantiene en reinicio. En ese modo, las funciones normales del controlador SPI se desconectan internamente y se desactivan.
Necesitaría proporcionar un poco de aislamiento para cualquiera de las señales SPI que puedan ser controladas por los circuitos externos de su placa. En este caso específico, no parece que ninguna de las señales de registro de desplazamiento se use como salida para regresar al AVR, por lo que no se necesita aislamiento adicional del circuito.
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