No, no creo que el autorouter Eagle pueda hacer eso. Puede establecer un grosor de traza en la clase de red, pero no conozco ninguna forma de hacer que el autorouter se dé cuenta del grosor usando varias pistas más delgadas.
Como nota al margen, solo porque las pistas tengan un alto voltaje no significa que deban ser gruesas. De hecho, el alto voltaje generalmente implica una menor corriente, por lo que si estas son las pistas que alimentan CA a una fuente de alimentación que emite un menor voltaje de CC, no necesitan ser tan gordas como esas pistas de CC. El problema con el alto voltaje es la distancia de otras pistas. Esto también se establece en la clase de red y será obedecido por el autorouter.
El enrutador automático Eagle es una herramienta decente que se puede usar para un buen efecto, pero no puede hacer todo por ti, y tienes que familiarizarte con él para obtener buenos resultados.