Absolutamente. De hecho, una de las primeras cosas que debe hacer es configurar sus plantillas y personalizar las reglas de diseño para que se ajusten a sus necesidades. Hable con el fabricante de su PCB para conocer sus preferencias y ajustar las reglas según sea necesario.
A medida que diseñes PCB, verás que es necesario modificar algunas reglas y puedes hacerlo según el diseño. Si ve que hace los mismos cambios una y otra vez, simplemente haga esos cambios en sus plantillas y estarán allí para su próximo proyecto.
Lo mismo se aplica a los esquemas, proyectos, trabajos de salida y otras plantillas.