Solo para agregar algunos números: simulé su circuito con los valores dados en su circuito y algunos valores predeterminados razonables (por ejemplo, Vcc = 9V y Vin = 1V pico a pico).
Los resultados son que opera el transistor muy cerca de las clasificaciones máximas.
Veo una disipación de potencia máxima de 627 mW y una disipación de potencia promedio de alrededor de 450 mW. La clasificación máxima para el 2N3904 es de 625 mW, por lo que no es de extrañar que el transistor se caliente rápidamente.
Si coloca un TIP41C en el circuito, aún debería poder medir una señal en la salida del amplificador, pero probablemente será mucho menor porque la ganancia de corriente del TIP41C es una magnitud menor en comparación con el 2N3904.
Como otros ya han sugerido, puede ejecutar el TIP41 y el 2N3904 en la configuración de Darlington. Eso te dará lo mejor de ambos mundos.
No obstante, a partir de la experiencia de aprendizaje, creo que su circuito es todo un éxito. Se está ejecutando con fuerza en el límite del 2N3904, pero por lo demás, se ve bien. Le sugiero que eche un vistazo a los amplificadores diferenciales a continuación. Son unos bloques de construcción muy importantes para los amplificadores de audio.