1) ¿Por qué querría la gente usar condensadores polarizados?
Porque, por lo general, tienen más capacidad por volumen y son más baratos. Busque valores como 1000uF, 2200uF, 4700uF o incluso más grandes que los de cerámica y encontrará la respuesta. Si su valor es bajo, no necesita topes polarizados.
2) ¿Cuál es el propósito del transformador?
Si el propósito del circuito es solo un doblador de voltaje, es para aislamiento. Pero puede lograr una mayor relación de voltajes con el transformador. Un transformador de aislamiento es un dispositivo de seguridad. Como la parte derecha del circuito está flotando, si toca solo en un punto del circuito, no se electrocutará. A pesar de estar apagado, por ejemplo, si toca el lado positivo del último condensador, se pondrá a tierra y el negativo será -V.
3) ¿Qué sucede si invierto la orientación de ambos diodos? Parece que invierte el signo del voltaje de salida, pero esto solo es posible utilizando condensadores no polarizados, lo que me lleva de nuevo a mi primera pregunta.
Si invierte los diodos, debe revertir también los condensadores.
También, en general, los condensadores no polarizados tienen menor inductancia y resistencias. Por lo tanto, actúan más rápido y son más adecuados para circuitos de altas frecuencias.