No pude encontrar una buena respuesta directa a la pregunta, pero hay algo que considerar con respecto a esta regla.
Personalmente nunca he usado esta regla y leí la documentación parece que es redundante de todos modos:
[Esta regla] detecta pines que no tienen red asignada ni pistas de conexión.
Básicamente, esta regla solo encontrará pins que no tengan sin red asignados. Los pines NC son muy comunes, por lo que debería usar la regla de redes no enrutadas en el nivel de PCB.
Los pines desconectados deben verificarse en el nivel del esquema (ejecutar ERC antes de enviar cambios a la PCB) y puede usar No ERC para marcar los pines que están desconectados por diseño.