Si este es un motor de CC con escobillas simple con solo dos conexiones, entonces sí, puede conectar un cable a la alimentación y usar un elemento de conmutación del lado bajo en el otro. No olvide colocar un diodo Schottky inverso en el motor, de lo contrario, el interruptor se destruirá a causa de los impulsos de alto voltaje.
A solo 12 V, puede encontrar FET de N canales que cambiarán lo suficientemente bien directamente desde una señal digital. Estos a menudo se denominan FET de "nivel logicl". En ese caso, no necesita un controlador FET.
Otra posibilidad es un NPN como interruptor. Es fácil manejar desde la lógica de bajo voltaje, pero apagar un bipolar saturado siempre es un poco complicado. Depende de qué tan rápido quieras ir. Para una frecuencia PWM normal del motor de aproximadamente 25 kHz, debería estar bien. Sin embargo, a menos que esté utilizando niveles lógicos inusualmente bajos o el micro tenga una unidad de salida débil, vería primero el nivel lógico FET del canal N.