Es poco probable que su circuito como se muestra funcione en absoluto.
Dado que la potencia disponible está en el uW a voltajes inferiores a 500 mV, no se me ocurre ningún circuito BJT que permita una solución.
Quizás debería comenzar por leer esto: enlace
Le sugiero que investigue la conversión de energía para generadores de termopila de metal (estos producen el rango de voltaje correcto, pero corrientes mucho más altas) donde hay algunos circuitos viables basados en FET como this . Incluso podría volver a visitar el Joule Thief basado en FET por ideas, aunque las pérdidas probablemente inundarían cualquier viabilidad.