No, no es un problema porque es un esquema en la hoja de datos. Si no puede confiar en eso, entonces los fabricantes de circuitos integrados tendrían grandes problemas.
Además, la aplicación de un 10 V "duro", que puede suministrar una gran corriente en el pin EN podría dañar el dispositivo (aunque lo dudo). Pero en este esquema, este 10 V es "blando" y no puede suministrar mucha corriente. Entonces, si algo en el pin EN comenzara a conducir, solo una pequeña corriente puede fluir y nada se dañará.
Puede verificar esto, construir el circuito y aplicar un Vin que dará como resultado 10 V en la entrada EN. Ahora mide ese voltaje. Si es de 10 V, el pin EN puede soportar más de 6 V. Si la tensión es muy inferior a 6 V, el valor alto de R5 salva el día.
Si está preocupado, puede ajustar los valores de R5 y R6 para obtener un máximo de 6 V en el pin EN. Luego observa que la EN será lo suficientemente alta en el Vin más bajo.