En general, esto es una mala idea.
Puede trabajar de esa manera pero puede causar problemas para el cargador. El cargador pensará que la corriente que está utilizando su módulo de refuerzo va a la batería. Esto puede hacer que el cargador cambie la tensión suministrada.
No se me ocurre ninguna forma de que pueda meterse en una situación peligrosa, pero dependiendo de la diferencia entre la corriente de carga y el consumo de energía del sistema, sería bastante fácil hacer que todo el sistema se dañe, evitar que la batería se cargue por completo o crear. Tiempos de carga muy largos.
En general, si tiene alimentación externa conectada, entonces desea ejecutar su sistema directamente desde esa fuente en lugar del gran impacto de eficiencia al reducirlo hasta el voltaje de la batería y luego volver a 5V. Exactamente la mejor manera de hacer esto depende de la tensión de entrada que tenga y del módulo de aumento de 5 V que esté utilizando. Algunos tienen entradas de alimentación externa, otros tienen una entrada de apagado. Si el que tiene no tiene ninguno de esos, ¿qué pasa si el pin de salida está en 5.1 V? ¿Se apaga efectivamente o conectaría 5V a la batería y dañaría las cosas?